В медицинската индустрия идентификационните кодове се включват главно в медицинските устройства, тъй като методът за маркиране с мастило е лесно премахнат.
Медицинската индустрия се нуждае от продукт, който е в състояние да контролира качеството на продукта и екологосъобразен, за да предотврати безскрупулните предприятия да смесват нездравословни медицински продукти в болници, които застрашават човешкото здраве. Поради това лазерната маркировка се превърна в нова технология, която подкопава медицинската индустрия, тъй като има предимството на безконтактна обработка, екологосъобразно, антисерумиране и т.н.
Използването на лазерни маркиращи машини за маркиране на медицинско оборудване като хирургически инструменти от неръждаема стомана и зъболекарско оборудване улеснява четенето.

